臺南市106年度總預算案歲出編列798億5,047萬7千元，除人事費375億4,280萬8千元，農民健康保險、中低收入老人生活津貼、國民年金補助、老農津貼、低收入戶家庭生活及就學補助、身心障礙者中低及低收入戶生活與保險補助等法定社會福利支出計52億5,762萬1千元，公務人員優惠存款差額利息補貼經費6億元，債務利息8億元、災害準備金11億4,727萬9千元、第二預備金4億元等法定經費外，另主要編列重點項目包括：
1. 路口監視器裝設、維修等相關經費、警消人員超勤加班費及警消辦公廳舍興建、整修等相關經費10億6,037萬1千元。
2. 65歲以上老人假牙經費1億5,000萬元。
3. 道路、橋樑及公園建設維護經費31億1,858萬7千元。
4. 路平專案計畫經費3億8,000萬元。
5. 陸軍飛彈砲兵訓練指揮部關廟校區二條聯外道路工程及南169線改道工程3億元。
6. 污水、雨水下水道建設工程及地上物補償費等12億3,713萬6千元。
7. 排水整治、抽水站及水閘門等工程19億328萬元。
8. 辦理竹溪親水綠廊營造設計監造及工程3億1,782萬8千元。
9. 生育獎勵金1億4,122萬2千元。
10. 補助各區基層建設及精神倫理活動及相關設施改善計畫等相關經費1億9,975萬7千元。
11. 105年1月寒害漁業產業專案輔導措施計畫3億9,104萬元。
12. 農路修建改善工程及農地重劃區農水路更新改善等工程經費5億3,847萬5千元。
13. 5歲幼兒免學費教育計畫5億1,949萬元。(中央補助，公立每人每年1萬元，私立每人每年3萬元)
14. 2-4歲幼兒教保券經費6億9,645萬元。(市負擔，公立每人每年1萬元，私立由每人每年1萬元調整為3萬元，增加經費4億4,365萬元)
15. 辦理老舊廁所及中小學老舊危險校舍整建經費2億8,000萬元。
16. 亞太國際棒球訓練中心興建計畫4億3,480萬元。
17. 老人重陽敬老金及禮品2億7,746萬3千元。
18. 大林、大同平價住宅拆遷照顧執行計畫1億9,150萬5千元。
19. 中石化（台鹼）安順廠污染案附近居民生活照顧及健康照護第3階段10年計畫1億1,000萬元。
20. 辦理長期照顧十年計畫2.0經費7億6,274萬9千元。
21. 美術館興建工程及委託國際徵圖、專案管理及監造等經費6億5,700萬元。
22. 臺南市立圖書館總館新建工程經費4億3,500萬元。
23. 臺南市菜寮化石文化園區改建工程經費1億5,600萬元。
24. 市定古蹟水交社宿舍群、文化景觀修復工程、眷村六大主題館展示工程及新化郡公會堂等古蹟及歷史建築修復工程4億6,963萬元。
25. 文化資產保存活化計畫2億8,077萬4千元。
26. 105年度住宅補貼計畫1億2,107萬6千元。
27. 中正路及海安路地區相關景觀改造工程及環境藝術經費1億125萬元。
28. 臺南市城西第三期垃圾衛生掩埋場活化再利用工程計畫2億4,800萬元。
29. 辦理垃圾焚化廠、掩埋場營運階段提供回饋金及掩埋場附近漁塭、農地等補償金1億8,721萬8千元。
30. 臺南市城西底渣再利用處理廠興建計畫7,000萬元。
31. 耐震補強經費1億6,020萬2千元。
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